1945 szeptemberétől az intézmény a Honvéd Laktanyában költözött be. Ebben az évben jelent meg a rendelet az általános iskolák megszervezéséről. 1949-ben a Honvéd téri laktanyát orosz katonaság foglalta el, iskolánkat pedig beköltöztették a város központjában az Ó- és Új-Kollégiumba. Az Új Kollégium épületből 1954-ben kiköltözött a Katona József Gimnázium és helyét iskolánk foglalhatta el. Ez az épület maradt otthona 23 évig. 1955-ben vette fel a II. Rákóczi Ferenc nevét. 1957 őszén elkészült a város háború utáni első iskola épülete: a Béke Téri Általános Iskola. Körzethatárait úgy jelölték ki, hogy zömét a Rákóczitól vették el, gyerekek és szülők nagy örömére. Iskolánk tanulóinak és a nevelőtestületének kb. a fele költözött a Béke térre. 1957-től 1973-ig a Rákóczi Iskolának új, nyugodt virágzó korszaka következett. Ezt az időszakot az állandóság jellemezte. Sok pedagógus és tisztviselő, akiknek ekkor már joga volt a szabad iskolaválasztáshoz, íratta be iskolánkba gyermekét. Az iskola központi helyzete, jó tantestülete, valamint az a tény vonzotta őket, hogy elsőtől-nyolcadikig ugyanabban az osztályközösségben maradhattak gyerekeik, ahol jól érezték magukat.
A Kecskeméti II. Rákóczi Ferenc Általános Iskola Kecskemét város egyik legellentmondásosabb sorsú oktatási intézménye. 54 évig nem volt állandó helye, hányódott más iskolák társbérletében, átszervezték, bővítették, megszüntetését tervezték; ugyanakkor tantestülete mindig egységes, jó közösség volt, pedagógusai ragaszkodtak egymáshoz és iskolájukhoz. Olyan jó pedagógiai légkört tudtak kialakítani, hogy a volt tanulók szívesen íratták ide gyermekeiket, felkeresve régi iskolájukat éppen pillanatnyi tartózkodási helyén. Az iskolatörténet leghitelesebb forrásai 1928-1944 között az évkönyvek, a háború után az anyakönyvek. Sok vita folyt már arról is, hogy egyáltalán mikortól számolhatjuk az iskola történetét. A jelenlegi II. Rákóczi Ferenc Általános Iskolának ugyanis két elődje volt, és két új iskola vált ki belőle. A folyamatosságot az 1928-ban alapított polgári fiúiskola és az 1994-ben alapított II. Rákóczi Ferenc Általános Iskola között a következő szempontok alapján lehet bizonyítani: 1.